Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL21Q9UJP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL21Q9UJP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL21Q9UJP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL21Q9UJP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms