Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3KQ9UBQ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF3KQ9UBQ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms