Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCDNQ9UBB6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCDNQ9UBB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCDNQ9UBB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCDNQ9UBB6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms