Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMOD4Q9NZQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD4Q9NZQ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD4Q9NZQ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD4Q9NZQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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