Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3EQ9NVU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR3EQ9NVU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3EQ9NVU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3EQ9NVU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms