Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJC17Q9NVM6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNAJC17Q9NVM6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJC17Q9NVM6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms