Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARVAQ9NVD7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARVAQ9NVD7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PARVAQ9NVD7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARVAQ9NVD7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARVAQ9NVD7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARVAQ9NVD7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARVAQ9NVD7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARVAQ9NVD7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms