Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB4Q9NTQ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GJB4Q9NTQ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJB4Q9NTQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 519 ms