Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPRSS4Q9NRS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms