Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASS4Q9NQ75 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASS4Q9NQ75 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms