Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1549Q9HCM3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIAA1549Q9HCM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA1549Q9HCM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549Q9HCM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms