Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRDQ9H2X0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRDQ9H2X0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRDQ9H2X0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRDQ9H2X0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRDQ9H2X0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRDQ9H2X0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms