Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM39BQ9GZU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM39BQ9GZU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM39BQ9GZU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM39BQ9GZU3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms