Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CFAP74Q9C0B2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CFAP74Q9C0B2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CFAP74Q9C0B2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CFAP74Q9C0B2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CFAP74Q9C0B2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms