Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM15Q9C019 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM15Q9C019 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM15Q9C019 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms