Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RQ9BZR6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4RQ9BZR6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4RQ9BZR6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4RQ9BZR6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms