Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-5Q9BYS1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms