Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BRIP1Q9BX63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
BRIP1Q9BX63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRIP1Q9BX63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms