Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIPINQ9BVW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIPINQ9BVW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIPINQ9BVW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TIPINQ9BVW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms