Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAL3ST1Q99999 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GAL3ST1Q99999 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GAL3ST1Q99999 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2927.2 ms