Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SCAF11Q99590 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAF11Q99590 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms