Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN18Q96SJ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN18Q96SJ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN18Q96SJ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms