Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALS2CR12Q96Q35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2CR12Q96Q35 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2CR12Q96Q35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms