Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1MQ96MI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPM1MQ96MI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1MQ96MI6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1MQ96MI6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms