Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE3Q96MG7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE3Q96MG7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms