Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD8Q96LT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD8Q96LT4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD8Q96LT4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms