Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C8orf48Q96LL4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8orf48Q96LL4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C8orf48Q96LL4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C8orf48Q96LL4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms