Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IMP4Q96G21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IMP4Q96G21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IMP4Q96G21 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IMP4Q96G21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms