Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP4Q96DX8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTP4Q96DX8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP4Q96DX8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms