Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UTP4Q969X6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UTP4Q969X6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTP4Q969X6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms