Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKL1Q969V6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKL1Q969V6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MKL1Q969V6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKL1Q969V6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms