Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRG4Q92954 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRG4Q92954 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRG4Q92954 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRG4Q92954 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PRG4Q92954 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms