Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB13Q92826 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB13Q92826 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB13Q92826 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB13Q92826 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms