Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP205Q92621 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP205Q92621 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP205Q92621 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP205Q92621 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP205Q92621 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP205Q92621 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP205Q92621 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP205Q92621 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP205Q92621 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms