Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DTX3LQ8TDB6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DTX3LQ8TDB6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DTX3LQ8TDB6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1176 ms