Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00612Q8N6U2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00612Q8N6U2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms