Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC82Q8N4S0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC82Q8N4S0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC82Q8N4S0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC82Q8N4S0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC82Q8N4S0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms