Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDDC3Q8N4P3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC3Q8N4P3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDDC3Q8N4P3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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