Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LOXHD1Q8IVV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LOXHD1Q8IVV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LOXHD1Q8IVV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LOXHD1Q8IVV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227 ms