Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4Q86YS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB11FIP4Q86YS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP4Q86YS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms