Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SKAP1Q86WV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SKAP1Q86WV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SKAP1Q86WV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SKAP1Q86WV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms