Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC190Q86UF4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC190Q86UF4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms