Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX6Q7RTT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX6Q7RTT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms