Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD4Q6ZMP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD4Q6ZMP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD4Q6ZMP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD4Q6ZMP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD4Q6ZMP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD4Q6ZMP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD4Q6ZMP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms