Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARA5Q6ZMJ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCARA5Q6ZMJ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCARA5Q6ZMJ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCARA5Q6ZMJ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms