Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3EQ6PEY2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3EQ6PEY2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3EQ6PEY2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms