Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4Q6IC98 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD4Q6IC98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms