Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200BQ69YZ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM200BQ69YZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM200BQ69YZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms