Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD4Q5XG99 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD4Q5XG99 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD4Q5XG99 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms