Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YOD1Q5VVQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YOD1Q5VVQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YOD1Q5VVQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.8 ms